Pašattīrīšanās sistēma attiecas uz sistēmu, kurai ir noteikta pašattīrīšanās pakāpe un vides piesārņotāju absorbcijas spēja. Tas ir agroekoloģisks komplekss, kurā vides piesārņotāji tiek pašattīrīti, ievērojot pieņēmumu, ka lauksaimniecības augsnes, augu un mikroorganismu fizikālās, ķīmiskās un bioloģiskās iedarbības rezultātā netiek pārsniegta vides kapacitāte.