Gēni ar īpašām funkcijām" float" līdzīgiem savvaļas augu celmiem, padarot tos izturīgus pret herbicīdiem un grūti kontrolējamus; vai izraisot kaitēkļu antivielu veidošanos pret insekticīdiem. Turklāt daži mazi radījumi var izzust pēc ēšanas ar ģenētiski modificētiem augiem ar insekticīdu funkcijām. Atbalstītāji norādīja, ka pati lauksaimnieciskā ražošana ir videi kaitīga darbība, un ģenētiski modificētās kultūras neradīs lielāku kaitējumu videi nekā tradicionālā lauksaimniecība. Augiem ir spēja pretoties kukaiņiem, un lauksaimnieki var samazināt insekticīdu izsmidzināšanu, kas ir labvēlīga videi un bioloģiskajai aizsardzībai.
Šādos strīdos nav viegli izdarīt secinājumus īsā laikā. Jāsaka, ka polemika par ģenētiski modificētām kultūrām ir normāla parādība. Pirmkārt, pašas jaunizveidotās šķirnes nav ideālas, un to vidēja un ilgtermiņa ietekme uz cilvēka ķermeni un vidi vēl ir redzama. Cilvēki izsaka bažas likumīgu iemeslu dēļ. Otrkārt, vienmēr būs daži konservatīvi cilvēki, kuri nav pieraduši pie jaunu tehnoloģiju produktiem un atsakās tos pieņemt. Tad ir tirdzniecības interešu konfliktu ietekme. Dažu valstu valdības un interešu grupas izmanto ģenētiski modificētu pārtikas produktu nepietiekamību, lai cīnītos ar tirdzniecības kariem, padarot lietas sarežģītākas.